通風柜的排風系統可分為集中式和分散式兩種。

  集中化是一層或幾層的通風柜系統，或者整個實驗樓分為一、二個系統。其特點是呼吸機少，設備投入，呼吸機數量略有增加和減少，以及位置的變化，都具有一定的適應性。但是，由于系統較大，風量不易平衡。雖然每個通風柜都裝有調節閥，使用起來很不方便，不容易達到理想的效果。如果系統風管損壞需要檢修，整個系統的通風機不能使用。因此，原有的實驗室集中式系統已被改為使用分散式系統。

  分散是一個通風柜或幾個通風柜在同一個房間，形成排氣系統。其特點是能根據通風機的工作需要，打開和關閉呼吸機，不受干擾，很容易達到預期效果，比集中式更節能。因為集中系統，如果有換氣扇在使用，我們就得啟動大型換氣扇。分布式系統體積小，排氣量小，阻力小，風機風量和風壓不大，噪聲和振動小。

  分散型也有一個特點，即易于處理排出不同性質的有害氣體。缺點是風機和風機系統的數量，如果你把重點放在通風室，那么如果風機分散，就地安裝，投資就會增加，雖然風機投資增加，但風管可以節省投資，總投資不一定會增加。建議使用分散劑。

  在系統劃分時，如果同一房間內有兩個以上的通風換氣，則應歸類為一個系統，以避免使用通風機，而其他通風柜則是為了使室內受到污染。此外，除了在一個房間的排氣系統，不適合重新安裝其他排氣設備。

  通風系統，通常安裝在屋頂上的通風的房間，或頂部，可使用面積不占用，和室內空氣的排氣管在真空狀態，從而避免由于腐蝕或管道損傷的有害物質，和管道不嚴密，滲透到內部，在此外，風機安裝在通風的房間在屋頂或頂部，維護方便，容易的噪音或振動。

  排放系統中有害物質的排放，應當按照《工業企業現行衛生標準》和《工業廢物排放標準》執行。一般情況下，如果附近沒有五十米高的建筑物，其高度應超過建筑物位置的兩米。